Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6CA6NDK9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6CA6NDK9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms