Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEB3A0JP26 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POTEB3A0JP26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEB3A0JP26 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms