Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
MAP3K4Q9Y6R4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MAP3K4Q9Y6R4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
MAP3K4Q9Y6R4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms