Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB2Q9Y5G2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHGB2Q9Y5G2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms