Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIT1Q9Y3P8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIT1Q9Y3P8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms