Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOP58Q9Y2X3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms