Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX4Q9Y2E6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX4Q9Y2E6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DTX4Q9Y2E6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms