Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4AQ9UMR7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4AQ9UMR7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4AQ9UMR7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4AQ9UMR7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4AQ9UMR7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4AQ9UMR7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC4AQ9UMR7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms