Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRPF3Q9ULD4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF3Q9ULD4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF3Q9ULD4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms