Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJC5

SH3BGRL2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2Q9UJC5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL2Q9UJC5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL2Q9UJC5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL2Q9UJC5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL2Q9UJC5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL2Q9UJC5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL2Q9UJC5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL2Q9UJC5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BGRL2Q9UJC5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL2Q9UJC5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRL2Q9UJC5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRL2Q9UJC5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms