Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC6Q9UBN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC6Q9UBN7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms