Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG4Q9UBN1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG4Q9UBN1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNG4Q9UBN1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG4Q9UBN1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms