Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFIP11Q9UBB9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFIP11Q9UBB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFIP11Q9UBB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFIP11Q9UBB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TFIP11Q9UBB9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TFIP11Q9UBB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFIP11Q9UBB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFIP11Q9UBB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms