Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO1Q9P1Z2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms