Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD3Q9NX63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD3Q9NX63 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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