Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C19orf12Q9NSK7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C19orf12Q9NSK7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms