Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMSN1Q9NSI8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms