Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX15Q9NRS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms