Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC2Q9NRP2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms