Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR39U1Q9NRG7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR39U1Q9NRG7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR39U1Q9NRG7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms