Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD163L1Q9NR16 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CD163L1Q9NR16 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CD163L1Q9NR16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms