Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN4Q9NQC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms