Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBN1Q9NPG3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBN1Q9NPG3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms