Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA1Q9NP55 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms