Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTN4Q9HB63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTN4Q9HB63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms