Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSS3Q9H6R3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms