Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA10Q9GZZ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA10Q9GZZ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms