Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1BQ9BZX4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms