Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL4Q9BYD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms