Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACSIN1Q9BY11 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms