Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARD11Q9BXL7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CARD11Q9BXL7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CARD11Q9BXL7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARD11Q9BXL7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms