Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDA1Q9BW61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDA1Q9BW61 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDA1Q9BW61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms