Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAAF1Q9BRP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAAF1Q9BRP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms