Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GL3Q99963 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms