Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSPAN18Q96SJ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN18Q96SJ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 795.7 ms