Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFMQ96QE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TEFMQ96QE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TEFMQ96QE5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TEFMQ96QE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TEFMQ96QE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TEFMQ96QE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TEFMQ96QE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TEFMQ96QE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms