Protein–RNA interactions for Protein: Q96PG1

MS4A4E, Putative membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4E, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4EQ96PG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MS4A4EQ96PG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4EQ96PG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms