Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN5

TCEANC2, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEANC2Q96MN5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TCEANC2Q96MN5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCEANC2Q96MN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCEANC2Q96MN5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms