Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC136Q96JN2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CCDC136Q96JN2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms