Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms