Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRRFQ96E11 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms