Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIT1Q92963 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIT1Q92963 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIT1Q92963 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms