Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSC1Q92574 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms