Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOPBP1Q92547 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOPBP1Q92547 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOPBP1Q92547 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOPBP1Q92547 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms