Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4AQ8WYN0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 445.7 ms