Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBXQ8WY36 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBXQ8WY36 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BBXQ8WY36 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBXQ8WY36 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBXQ8WY36 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBXQ8WY36 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBXQ8WY36 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBXQ8WY36 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBXQ8WY36 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms