Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A3Q8WWT9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A3Q8WWT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A3Q8WWT9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms