Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKUQ8WUA8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms