Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCOLN3Q8TDD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms