Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC9Q8TBE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms